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ゲノムプロジェクトとは、シークエンシングによって生物のゲノムの全塩基配列を解読しようとするプロジェクト。当初はヒトをはじめ、マウスや線虫などのモデル生物が主な対象であったが、多くの生物種に対象は拡大しつつある。各国の公的研究機関がチームを組んでプロジェクトを進行させるケースが多いが、イネや小麦などの主要農産物については企業による解読もなされた。

塩基配列情報は重要なものではあるが、それだけでは生物の理解には不十分であり、遺伝子領域や制御領域の認識、それらの役割の解明などを進めていくことが望まれる。これらの研究をポストゲノムと総称する。

◆ゲノムプロジェクトとモデル生物の一覧

◇後生動物 Metazoa

・節足動物 Arthropoda:

  ・ネッタイシマカ(デング熱) Aedes aegypti

  ・ヒトスジシマカ Aedes albopictus

  ・ Aedes triseriatus

  ・マダニ Amblyomma americanum

  ・ハマダラカ (マラリア) Anopheles gambiae: 2002年10月

  ・ミツバチ Apis mellifera ligustica

  ・カイコ Bombyx mori:2004年2月29日

  ・アカイエカ Culex pipiens

  ・キイロショウジョウバエ Drosophila melanogaster:BDGP, Celera, 2000年3月24日

  ・ツェツェバエ (トリパノソーマ) Glossina morsitans

  ・キョウソヤドリコバチ Nasonia vitripennis

・脊索動物 Chordata:

  ・ウシ Bos taurus: 進行中

  ・イヌ Canis familiaris

  ・ウマ Equus caballus: 進行中

  ・ネコ Felis catus: 進行中

  ・ヒト Homo sapiens

  ・マウス Mus musculus:

  ・チンパンジー Pan troglodytes

  ・ラット Rattus norvegicus:2004年4月1日

  ・イノシシ、ブタ Sus scrofa

  ・ニワトリ Gallus gallus

  ・アフリカツメガエル Xenopus laevis

  ・アフリカツメガエル Xenopus tropicalis

  ・メダカ Oryzias latipes: 700 Mbp, NIG、東京大学, 2007年

  ・ゼブラフィッシュ Danio rerio: 進行中

  ・トラフグ Fugu rubripes: 365 Mbp

  ・ミドリフグ Tetraodon nigroviridis

  ・カタユウレイボヤ Ciona intestinalis

・線形動物 Nematoda:

  ・マレー糸状虫(フィラリア) Brugia malayi

  ・ Caenorhabditis briggsae

  ・ Caenorhabditis elegans: 100.274 Mbp, サンガーセンター、ワシントン大学, 1998年

・吸虫 Trematoda:

  ・日本住血吸虫 Schistosoma japonicum

  ・マンソン住血吸虫 Schistosoma mansoni

◇植物 Plantae

・シロイヌナズナ Arabidopsis thaliana

・トマト Lycopersicon esculentum

・タルウマゴヤシ Medicago truncatula

・イネ Oryza sativa

・ミヤコグサ Lotus japonicus

・ポプラ Populus trichocarpa

・ブドウ Vitis vinifera: 467.5 Mbp, フランス&イタリア, 2007年

◇菌類 Fungi

・子嚢菌 Ascomycota:

  ・ アスペルギルス(コウジカビ類)Aspergillus fumigatus

  ・アスペルギルス・ニデュランス Aspergillus nidulans

  ・アスペルギルス Aspergillus parasiticus

  ・アスペルギルス Aspergillus terreus

  ・カンジダ Candida albicans

  ・カンジダ Candida glabrata CBS138

  ・ Debaryomyces hansenii

  ・ Fusarium sporotrichioides

  ・イネバカナエ菌病菌 Gibberella zeae PH-1

  ・ Kluyveromyces lactis

  ・アカパンカビ Neurospora crassa

  ・ニューモシスチス・カリニ(カリニ肺炎) Pneumocystis carinii

  ・出芽酵母 Saccharomyces cerevisiae

  ・分裂酵母 Schizosaccharomyces pombe

  ・ Yarrowia lipolytica

・担子菌 Basidiomycota:

  ・クリプトコッカス Cryptococcus neoformans

  ・ Phanerochaete chrysosporium

・微胞子虫 Microsporidia:

  ・ Encephalitozoon cuniculi

◇原生生物

・アピコンプレックス門 Apicomplexa:

  ・ Babesia bovis

  ・ Eimeria tenella

  ・クリプトスポリジウム Cryptosporidium parvum

  ・クリプトスポリジウム Cryptosporidium hominis TU502

  ・ Plasmodium berghei

  ・ Plasmodium chabaudi

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